Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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PTPRRQ15256 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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PTPRRQ15256 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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PTPRRQ15256 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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PTPRRQ15256 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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PTPRRQ15256 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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PTPRRQ15256 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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PTPRRQ15256 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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