Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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