Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms