Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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