Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms