Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPSQ13938 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
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CAPSQ13938 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPSQ13938 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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