Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
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