Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PWP1Q13610 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms