Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms