Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SMAD4Q13485 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
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