Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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SKP2Q13309 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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SKP2Q13309 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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SKP2Q13309 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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SKP2Q13309 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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SKP2Q13309 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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