Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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