Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
GRIN2BQ13224 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
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