Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBX3Q13185 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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