Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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