Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
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