Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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