Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC10A2Q12908 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms