Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GRIN2AQ12879 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2AQ12879 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms