Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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RAB40BQ12829 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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RAB40BQ12829 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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RAB40BQ12829 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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RAB40BQ12829 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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RAB40BQ12829 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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RAB40BQ12829 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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RAB40BQ12829 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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RAB40BQ12829 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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RAB40BQ12829 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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