Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCBP1Q09161 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms