Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLEQ07864 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLEQ07864 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLEQ07864 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLEQ07864 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLEQ07864 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLEQ07864 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLEQ07864 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLEQ07864 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLEQ07864 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLEQ07864 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLEQ07864 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLEQ07864 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLEQ07864 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLEQ07864 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLEQ07864 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLEQ07864 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLEQ07864 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLEQ07864 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLEQ07864 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLEQ07864 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLEQ07864 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLEQ07864 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLEQ07864 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLEQ07864 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLEQ07864 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLEQ07864 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLEQ07864 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLEQ07864 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLEQ07864 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLEQ07864 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLEQ07864 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLEQ07864 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLEQ07864 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLEQ07864 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLEQ07864 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLEQ07864 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLEQ07864 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLEQ07864 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLEQ07864 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLEQ07864 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLEQ07864 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLEQ07864 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLEQ07864 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLEQ07864 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLEQ07864 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLEQ07864 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLEQ07864 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLEQ07864 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLEQ07864 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLEQ07864 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLEQ07864 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLEQ07864 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLEQ07864 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLEQ07864 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLEQ07864 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLEQ07864 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLEQ07864 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLEQ07864 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLEQ07864 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLEQ07864 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLEQ07864 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLEQ07864 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLEQ07864 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLEQ07864 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLEQ07864 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLEQ07864 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms