Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms