Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms