Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LTBQ06643 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LTBQ06643 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LTBQ06643 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LTBQ06643 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LTBQ06643 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LTBQ06643 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LTBQ06643 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LTBQ06643 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LTBQ06643 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LTBQ06643 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LTBQ06643 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBQ06643 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBQ06643 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBQ06643 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBQ06643 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBQ06643 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBQ06643 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBQ06643 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBQ06643 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBQ06643 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBQ06643 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBQ06643 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBQ06643 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBQ06643 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBQ06643 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBQ06643 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBQ06643 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBQ06643 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBQ06643 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBQ06643 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBQ06643 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBQ06643 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBQ06643 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBQ06643 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBQ06643 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBQ06643 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBQ06643 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBQ06643 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBQ06643 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBQ06643 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBQ06643 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBQ06643 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBQ06643 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBQ06643 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBQ06643 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBQ06643 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBQ06643 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBQ06643 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBQ06643 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBQ06643 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBQ06643 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBQ06643 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBQ06643 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms