Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms