Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms