Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms