Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms