Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms