Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms