Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms