Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAP84074 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAP84074 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAP84074 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAP84074 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAP84074 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAP84074 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAP84074 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAP84074 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAP84074 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAP84074 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAP84074 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAP84074 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAP84074 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAP84074 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAP84074 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAP84074 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAP84074 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAP84074 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAP84074 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAP84074 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAP84074 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAP84074 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAP84074 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAP84074 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAP84074 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAP84074 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAP84074 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAP84074 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAP84074 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HPCAP84074 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAP84074 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAP84074 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAP84074 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAP84074 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAP84074 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAP84074 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAP84074 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAP84074 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAP84074 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAP84074 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAP84074 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAP84074 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAP84074 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAP84074 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAP84074 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAP84074 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAP84074 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAP84074 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAP84074 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAP84074 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAP84074 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAP84074 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAP84074 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAP84074 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAP84074 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAP84074 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAP84074 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAP84074 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAP84074 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAP84074 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAP84074 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAP84074 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAP84074 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAP84074 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAP84074 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAP84074 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAP84074 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAP84074 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAP84074 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAP84074 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAP84074 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAP84074 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAP84074 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAP84074 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAP84074 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms