Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASIC1P78348 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms