Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P62684 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms