Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms