Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D1P54289 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms