Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOSBP53539 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOSBP53539 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOSBP53539 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOSBP53539 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOSBP53539 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOSBP53539 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOSBP53539 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOSBP53539 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOSBP53539 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOSBP53539 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOSBP53539 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOSBP53539 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOSBP53539 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOSBP53539 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOSBP53539 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOSBP53539 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOSBP53539 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOSBP53539 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOSBP53539 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOSBP53539 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOSBP53539 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOSBP53539 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOSBP53539 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOSBP53539 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOSBP53539 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOSBP53539 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOSBP53539 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FOSBP53539 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOSBP53539 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOSBP53539 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FOSBP53539 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOSBP53539 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FOSBP53539 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOSBP53539 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOSBP53539 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOSBP53539 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOSBP53539 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOSBP53539 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOSBP53539 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOSBP53539 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOSBP53539 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FOSBP53539 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOSBP53539 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOSBP53539 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOSBP53539 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FOSBP53539 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOSBP53539 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOSBP53539 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOSBP53539 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOSBP53539 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOSBP53539 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOSBP53539 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOSBP53539 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOSBP53539 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FOSBP53539 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FOSBP53539 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOSBP53539 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOSBP53539 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOSBP53539 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOSBP53539 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOSBP53539 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOSBP53539 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOSBP53539 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FOSBP53539 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOSBP53539 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOSBP53539 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOSBP53539 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOSBP53539 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOSBP53539 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOSBP53539 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOSBP53539 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOSBP53539 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOSBP53539 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOSBP53539 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOSBP53539 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOSBP53539 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOSBP53539 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOSBP53539 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOSBP53539 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOSBP53539 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOSBP53539 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOSBP53539 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOSBP53539 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOSBP53539 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOSBP53539 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOSBP53539 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOSBP53539 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOSBP53539 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOSBP53539 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOSBP53539 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOSBP53539 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOSBP53539 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOSBP53539 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOSBP53539 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOSBP53539 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOSBP53539 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOSBP53539 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOSBP53539 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FOSBP53539 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms