Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ACLYP53396 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACLYP53396 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACLYP53396 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ACLYP53396 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ACLYP53396 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACLYP53396 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ACLYP53396 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACLYP53396 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACLYP53396 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ACLYP53396 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ACLYP53396 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACLYP53396 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACLYP53396 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ACLYP53396 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACLYP53396 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACLYP53396 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACLYP53396 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACLYP53396 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACLYP53396 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACLYP53396 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACLYP53396 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACLYP53396 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACLYP53396 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACLYP53396 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACLYP53396 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACLYP53396 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ACLYP53396 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACLYP53396 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ACLYP53396 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACLYP53396 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACLYP53396 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ACLYP53396 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ACLYP53396 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACLYP53396 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACLYP53396 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACLYP53396 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACLYP53396 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACLYP53396 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACLYP53396 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ACLYP53396 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACLYP53396 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ACLYP53396 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACLYP53396 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACLYP53396 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACLYP53396 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACLYP53396 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACLYP53396 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACLYP53396 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACLYP53396 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACLYP53396 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACLYP53396 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACLYP53396 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACLYP53396 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACLYP53396 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ACLYP53396 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ACLYP53396 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ACLYP53396 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACLYP53396 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACLYP53396 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACLYP53396 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACLYP53396 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACLYP53396 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACLYP53396 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACLYP53396 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACLYP53396 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACLYP53396 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACLYP53396 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACLYP53396 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACLYP53396 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACLYP53396 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACLYP53396 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACLYP53396 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACLYP53396 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACLYP53396 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACLYP53396 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACLYP53396 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ACLYP53396 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACLYP53396 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ACLYP53396 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACLYP53396 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ACLYP53396 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACLYP53396 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACLYP53396 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACLYP53396 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACLYP53396 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ACLYP53396 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACLYP53396 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACLYP53396 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACLYP53396 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACLYP53396 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACLYP53396 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACLYP53396 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ACLYP53396 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACLYP53396 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ACLYP53396 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ACLYP53396 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ACLYP53396 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACLYP53396 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ACLYP53396 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms