Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms