Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCAMP50895 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCAMP50895 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCAMP50895 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BCAMP50895 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCAMP50895 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCAMP50895 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCAMP50895 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCAMP50895 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAMP50895 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAMP50895 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAMP50895 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAMP50895 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAMP50895 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAMP50895 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAMP50895 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAMP50895 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAMP50895 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAMP50895 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAMP50895 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAMP50895 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAMP50895 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAMP50895 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAMP50895 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAMP50895 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAMP50895 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAMP50895 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAMP50895 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAMP50895 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAMP50895 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAMP50895 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAMP50895 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAMP50895 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAMP50895 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAMP50895 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAMP50895 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAMP50895 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAMP50895 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAMP50895 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAMP50895 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAMP50895 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAMP50895 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAMP50895 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAMP50895 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAMP50895 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAMP50895 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAMP50895 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAMP50895 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAMP50895 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAMP50895 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAMP50895 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAMP50895 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAMP50895 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAMP50895 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAMP50895 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAMP50895 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAMP50895 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAMP50895 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAMP50895 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAMP50895 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAMP50895 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAMP50895 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAMP50895 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAMP50895 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAMP50895 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAMP50895 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAMP50895 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAMP50895 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAMP50895 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAMP50895 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAMP50895 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAMP50895 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAMP50895 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAMP50895 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAMP50895 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAMP50895 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAMP50895 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAMP50895 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAMP50895 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAMP50895 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAMP50895 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAMP50895 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAMP50895 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAMP50895 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAMP50895 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAMP50895 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAMP50895 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAMP50895 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAMP50895 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAMP50895 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAMP50895 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAMP50895 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAMP50895 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAMP50895 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAMP50895 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BCAMP50895 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BCAMP50895 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BCAMP50895 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BCAMP50895 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BCAMP50895 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms