Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLCSP50747 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLCSP50747 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLCSP50747 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLCSP50747 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLCSP50747 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLCSP50747 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLCSP50747 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HLCSP50747 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HLCSP50747 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLCSP50747 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLCSP50747 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLCSP50747 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLCSP50747 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLCSP50747 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLCSP50747 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLCSP50747 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLCSP50747 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLCSP50747 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLCSP50747 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLCSP50747 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLCSP50747 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLCSP50747 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLCSP50747 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLCSP50747 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLCSP50747 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLCSP50747 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLCSP50747 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLCSP50747 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms