Protein–RNA interactions for Protein: P48775

TDO2, Tryptophan 2,3-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDO2P48775 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDO2P48775 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDO2P48775 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDO2P48775 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDO2P48775 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDO2P48775 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDO2P48775 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDO2P48775 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDO2P48775 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDO2P48775 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDO2P48775 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDO2P48775 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDO2P48775 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TDO2P48775 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDO2P48775 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDO2P48775 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDO2P48775 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDO2P48775 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDO2P48775 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TDO2P48775 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDO2P48775 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDO2P48775 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDO2P48775 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TDO2P48775 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDO2P48775 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDO2P48775 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDO2P48775 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDO2P48775 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDO2P48775 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDO2P48775 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TDO2P48775 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TDO2P48775 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDO2P48775 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDO2P48775 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TDO2P48775 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDO2P48775 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDO2P48775 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDO2P48775 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TDO2P48775 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TDO2P48775 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TDO2P48775 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TDO2P48775 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TDO2P48775 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDO2P48775 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDO2P48775 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDO2P48775 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TDO2P48775 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TDO2P48775 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDO2P48775 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDO2P48775 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDO2P48775 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDO2P48775 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDO2P48775 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDO2P48775 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDO2P48775 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDO2P48775 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDO2P48775 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TDO2P48775 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TDO2P48775 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDO2P48775 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDO2P48775 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDO2P48775 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDO2P48775 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDO2P48775 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDO2P48775 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDO2P48775 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDO2P48775 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDO2P48775 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDO2P48775 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDO2P48775 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDO2P48775 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TDO2P48775 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDO2P48775 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDO2P48775 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDO2P48775 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDO2P48775 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDO2P48775 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TDO2P48775 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TDO2P48775 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDO2P48775 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDO2P48775 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDO2P48775 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDO2P48775 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDO2P48775 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDO2P48775 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDO2P48775 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDO2P48775 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDO2P48775 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDO2P48775 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDO2P48775 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDO2P48775 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDO2P48775 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDO2P48775 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDO2P48775 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDO2P48775 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDO2P48775 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDO2P48775 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TDO2P48775 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDO2P48775 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDO2P48775 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms