Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms