Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms