Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK1P39086 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms