Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms