Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA3P35244 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA3P35244 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA3P35244 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA3P35244 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA3P35244 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA3P35244 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA3P35244 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA3P35244 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA3P35244 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA3P35244 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA3P35244 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA3P35244 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA3P35244 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA3P35244 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA3P35244 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA3P35244 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA3P35244 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA3P35244 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA3P35244 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA3P35244 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA3P35244 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA3P35244 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA3P35244 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA3P35244 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA3P35244 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA3P35244 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA3P35244 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA3P35244 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA3P35244 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA3P35244 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA3P35244 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA3P35244 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA3P35244 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA3P35244 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA3P35244 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA3P35244 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA3P35244 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA3P35244 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA3P35244 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA3P35244 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA3P35244 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA3P35244 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA3P35244 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA3P35244 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA3P35244 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA3P35244 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA3P35244 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA3P35244 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA3P35244 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA3P35244 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA3P35244 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA3P35244 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA3P35244 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA3P35244 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA3P35244 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA3P35244 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA3P35244 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA3P35244 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA3P35244 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA3P35244 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA3P35244 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA3P35244 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA3P35244 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA3P35244 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA3P35244 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA3P35244 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA3P35244 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA3P35244 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms