Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA7P31268 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms