Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD1P28340 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD1P28340 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD1P28340 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD1P28340 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD1P28340 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD1P28340 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD1P28340 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD1P28340 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD1P28340 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD1P28340 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD1P28340 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD1P28340 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD1P28340 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD1P28340 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD1P28340 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD1P28340 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD1P28340 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD1P28340 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD1P28340 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD1P28340 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD1P28340 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD1P28340 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD1P28340 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD1P28340 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD1P28340 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD1P28340 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD1P28340 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD1P28340 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD1P28340 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD1P28340 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD1P28340 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD1P28340 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD1P28340 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLD1P28340 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLD1P28340 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLD1P28340 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLD1P28340 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLD1P28340 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLD1P28340 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLD1P28340 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POLD1P28340 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLD1P28340 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLD1P28340 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLD1P28340 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POLD1P28340 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLD1P28340 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLD1P28340 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD1P28340 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD1P28340 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD1P28340 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD1P28340 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD1P28340 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD1P28340 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD1P28340 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD1P28340 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD1P28340 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD1P28340 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD1P28340 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD1P28340 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD1P28340 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD1P28340 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD1P28340 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD1P28340 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD1P28340 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLD1P28340 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLD1P28340 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLD1P28340 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
POLD1P28340 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLD1P28340 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLD1P28340 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLD1P28340 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLD1P28340 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLD1P28340 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLD1P28340 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLD1P28340 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLD1P28340 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLD1P28340 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLD1P28340 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
POLD1P28340 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
POLD1P28340 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLD1P28340 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLD1P28340 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLD1P28340 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLD1P28340 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLD1P28340 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLD1P28340 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
POLD1P28340 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLD1P28340 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLD1P28340 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLD1P28340 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLD1P28340 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLD1P28340 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLD1P28340 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLD1P28340 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLD1P28340 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLD1P28340 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLD1P28340 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLD1P28340 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLD1P28340 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms